同样的，被柯南带回来的灰原哀，也就是宫野志保。回到组织后，一直从事原来的科研工作
三年的时间，不仅仅源制出APT X4869的解药，野人家发现了许多新的药物，适用于各种途径，有的温柔，有的残酷，你得神不知鬼不觉……
虽然APT X4869的解药研究出来了，但因为他们曾服用过暂时性解药，身体内产生了抗体，即使吃了这次研究的解药，也只是暂时的
但每次恢复的时间都有72小时，即使反复吃，也不会增加，也不会缩短，也不会有什么副作用，这算是一大好处，只是每次变大或变小的疼痛，都会是原来的3倍
但他们都不在意，也就随遇而安，继续保持着小孩子的身体，反正又不影响他们的工作，哟，还能比以前多活几年？何乐而不为呢？
当然，科学天赋绝顶的宫野志保在科学界，更是一位大佬在世界科学榜的第一名上稳如泰山
因为当初在阿笠博士的渲染下，导致他在发明上也有所研究，有时常搞些小发明，只是没有被世人知道罢了
再说其他人……
小兰只是觉得自己从小暗恋的青梅竹马走了，一开始是有些悲伤的，但慢慢地接受了事实……
而毛利小五郎就不同了，因为没有了柯南的帮助，也就没有了沉睡的小五郎，没有了柯南，毛利小五郎几乎很多次都会把案件搞得一塌糊涂，有时甚至还把警官带歪了，渐渐地，毛利小五郎又恢复了从前没有工作的时候……
少年侦探团叶和毛利小五郎差不多，但也不至于像他那样这么惨，少年侦探团一下失去了柯南和灰原两位大将，有时一件小事可能就是一起案件的重要关键，却因为没有及时发现而错失良机，遇到的案件永远不可能再像往常一样轻而易举了，慢慢的，他们也只能凭借以前和柯南一起破案的经验解决一些小事，比如：帮同学找猫……
随着时间的流逝，案件（新手被认为是柯南的那个）的深入，当警察终于找到被害人遗失的四件物品时，却发现了一个奇怪的问题……
第一件物品沾染上了被害人与柯南的指纹；
第二件物品沾染上了被害人的指纹；
第三件物品沾染上了柯南的指纹；
第四件物品没有沾染上任何指纹！
并且每件物品上都有被擦拭指纹的痕迹！
（因为这些物品都有被害人名字的缩写，所以也就得到被害人家属的确认，所以确定这些一开始遗失的物品是被害人的）
这个奇怪的现象让警察瞬间摸不着头脑，也对，柯南你是不是凶手产生了怀疑……
于是警察不得不重新思考梳理这整起案件，经过多次研究与探索，但依然没有任何结论
于是，这起案件最终被定为：悬案……
在一个昏暗的办公室里，柯南十分认真地浏览着面前的电脑屏幕……
“噔噔噔”
柯南冷冷的说着：“进”
走进来的赫然是灰原哀，此时，柯南态度的，360度大变样，热情的说着：“哀，你不是说过吗？你进来的时候不用敲门的”语气温柔，跟之前冰冷的态度形成一个鲜明的对比
灰原哀也只是叹了口气，你是和柯南一样的温柔：“柯，这不符合规矩”
柯南满脸宠溺的说：“规矩，我定的，你可以不用遵守”
此时，苦艾酒恰巧来汇报工作……
“噔噔噔”
不能又恢复之前的冰冷：“进”
苦艾酒走进办公室，看见灰原哀在办公室里也已经见怪不怪了，毕竟，灰原哀和boss，已经是熟人能知的小情侣了
苦艾酒将一份资料双手递给了柯南，接着点说了一大堆关于这整件项目的事……
柯南看完这几张薄薄的纸厚，冷笑一声：“呵……又弄丢了？很好！把负责这些项目的成员带到“䡾”那里去领罚吧！对了，是第五层”
苦艾酒有些为难：“这……那他们不就……”
柯南没有去管苦艾酒，说的这些话，只是自顾自的说：“这你就不用管了，他们要是在那里撑不下去了，就不用留在这个组织了，包括这个世界……”
苦艾酒听到这里，也只好应下：“是！Boss！”
灰原亲眼目睹了这个过程，对于柯南来到组织后的狠辣，已经习惯了了，毕竟她的“柯”可不是这样对他的，不过这次倒让他稍有些意外
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