该年，次子羹尧参加顺天京闱高中第四十二名，不第士子揭帖，声言此次科场腐败，贿赂公行，其中，湖抚年遐龄为子馈赠考官一万两。主副考官二人李蟠，姜宸英因此下狱。姜宸英在狱中留书喊冤，服毒自尽。康熙亲自带领皇子监考，举行重试。认为从考试结果来看，本次科举案为不第之人嫉妒冤诬所致，年羹尧由是中举。（见《清圣祖实录》《永宪录》以及《养吉斋丛录》）
康熙三十九年，五十八岁，自正月起，湖广七府亩税新制施行，二月与总督郭琇具题内阁，议定新税法章程。该年清查库帑亏空，因以往督抚、司道州府等有三十余人因操办历年军需，浩繁过巨，亏空无法补足而上折题援恩诏，请户刑工三部会议酌免追比。七月十三日与总督郭琇再次合词保题徐惺，豁免其银豆追取，圣祖从议。七月二十四日，与总督郭琇合词具题湖广移员弭盗章程，八月部议允行，九月奉旨施行。（《华野疏稿》） 该年四月，年羹尧参加会试，考中进士，之后于畅春园经由圣祖躬亲核试，钦点庶吉士。
康熙四十年（辛巳），五十九岁，二月己未，给事中马士芳参奏湖广省大计巡抚年遐龄徇庇湖北布政使任风厚老病不行，得旨，著王国昌年遐龄各行明白回奏。任风厚可著来京引见。三月丙辰，任风厚到京，圣祖面见其人，知马士芳所奏不实，因其为言官，免予处分。（见王先谦《东华录》）（《八旗通志》：“四十年二月，给事中马士芳劾遐龄徇庇老病废弛之布政司任风厚不入大计，诏令明白回奏。风厚来京引见，嗣遐龄奏风厚办事老成并无遗误，风厚抵京引见，谕曰任风厚尚未衰老，可以办事，着仍赴原任。马士芳劾奏不实，以言官免其议处。”）
该年正月十七日，总督郭琇因老病乞休，请圣祖将总督一职付由年遐龄署理。二月，圣祖下旨挽留郭琇，以年遐龄署理湖广总督事务。（见《楚南苗志》赵申乔奏疏，年遐龄曾与康熙四十二年前后署理总督）。 该年，与总督郭琇合词保题湖广二省郡丞升调等事。五月十七日，又合词保题道员升调等事。
该年十月初七，因监察御史左必蕃题参湖广总督巡抚二人失察属下知府挟私等情奉旨回奏，因黄梅县地丁银亏空案处理不公，督抚二人具降一级留用。（见《华野疏稿》。《八旗通志》：“七月，遐龄疏参黄梅县知县李锦亏空地丁银三千余两，请革职究追，从之。寻黄梅县民会集万人，闭城留锦不容去，任命总督郭琇严审速奏，八月琇奏言黄梅县未解银三千余两，实系民欠，随于七月征完，知县李锦并无亏空，百姓因锦平日清廉闻其解任一时围聚生员吴士光等许为纠人赴省保留，久始解散亦无违抗情形，请令锦仍留原任，士光等革去衣顶，应请复还。得旨，凡官员去留之权岂可令百姓干预，聚众肆行之风亦渐不可长，该督抚庸懦无能，平时不能约束军民，及至事出专务，饰苟且议结，殊属不合。李锦居官虽优，不可仍留黄梅之任，着令来京于直，附近补用。吴士光等着解部，发往奉天，郭琇、年遐龄俱降一级留任。”）
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