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“柯南…是新一哥哥吗？”步美低声喃喃，很是落寞，自己喜欢上的是比自己大十岁，小兰姐的男朋友……
灰原轻叹口气，看了某个低情商的大侦探一眼，“步美，喜欢他并不是一件错事，尽管他是工藤新一，但他也是江户川柯南，和你们在一起生活的日子，他是不会忘的”
“嗯！”步美重新振作了起来
吉田步美『至少现在他还是柯南啊』
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变小的工藤新一被带到了医务室，他向警察讲述事情的经过，可他们并不相信，他逐渐发现了不对劲，去到镜子前，新一看着镜子中缩水的自己，不敢相信。
『不是吧…我的身体居然真的缩小了！』
听到警察要送他去托儿所，他立马跑走了，躲在一个草丛后，这时他接到了毛利事物所的电话，一眼就知道是小兰打来的，本想让她来接自己，却犹豫了，因为解释不清这件事
他跑到自家门口，却发现一个极其可笑的事，自己因为身体变小，竟然够不到自己家的门锁…
正在他烦躁时，隔壁又爆炸了，阿笠博士被炸了出来，他立刻跑了过去，向他说明：“阿笠博士，我是新一！”
阿笠博士却指指隔壁：“如果你要找工藤新一的话，他就在隔壁”阿笠博士明显没听清，最后，在新一解释了好多遍，用了各种方法，和一个动作，终于让阿笠博士相信了他。
兰打新一电话不通，放心不下来最后赶来他家查看情况，结果却没找到他，却带回了化名为江户川柯南的变小的新一
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“啊——！兰，我想起来了！”园子一拍脑门，“你之前还和这个推理狂一起洗澡睡觉，他他他…”
江户川柯南『糟了』
他偷偷斜眼，看着旁边的小兰渐渐变得通红的面色，还有紧攥的双拳，以及一旁妃律师镜片反着的寒光和被紧紧拉住的毛利大叔，不自觉咽了咽口水，所幸小兰没做什么，但他还是为自己的未来感到深深的担忧……
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随着时间推移，工藤新一作为柯南，寄住在小兰家，却发现毛利小五郎其实是个三流侦探
于是柯南便使用阿笠博士的发明，加上自己的推理，成功使毛利小五郎成为了名侦探“沉睡的小五郎”
画面一转，工藤新一捂着胸口，喘着气，对服部平次说:
“推理根本就没什么输赢和高低之分，因为真相永远只有一个”
柯南被成实医生扔出火灾，他在弹奏最后的钢琴暗号
得知组织的颜色是黑色，可惜没有救下广田雅美（宫野明美）
与怪盗基德的第一次碰面……
在工藤新一变小的两个月后，一群人悄悄潜入工藤宅，带头的是一个茶发少女，她去到新一的卧室，注意到他小时候的衣服全部都不见了，突然想起了她姐姐的话：
“就是那个之前和你提过的戴眼镜的小男孩，我觉得他很奇怪，明明只是小孩却感觉十分沉稳，还很成熟”
后来，她到了实验室，看着表格上“工藤新一”的“不明”，她改成了“死亡”，改好后签上了自己的名字“Sherry”签好后，她笑了笑，她不知道，这个举动，在不久的将来，她不仅救了工藤，也救了自己。
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