由于警方的专业验尸人员没有来，只能再次由浅井成实来验尸。
“警官，死者的凳子底下有奇怪的痕迹！”
众人一听连忙过去看，那是一段乐谱，是凶手留下的。
藤原叶再次打了一个哈欠，明显就是昨晚没有睡好，柯南看着藤原叶眼下那细微的黑眼圈，跑过去：“藤原姐姐我会很快找到凶手的！”
藤原叶俯下身，摸了摸柯南的头：“加油哦~小侦探。”
看着藤原叶挨得极近的脸颊，柯南再次红了耳朵，连忙偏头跑开了。
藤原叶直起腰，死亡时间就是在几分钟前，那么凶手的范围一下就缩小了，再加上黑岩先生的女儿在这段时间一直被问话，可以排除嫌疑，而小兰又是浅井成实的不在场证明，可是，真的有这么简单吗？
目暮警官询问西本先生：“那么西本先生，你问什么会去广播室呢？”
西本先生的脸色十分不对，而且还很慌张：“那是因为是黑岩叫我过去的！”
柯南没有去听他们的对话，而是再看手中的小本子，上面记载着两个死者死前的乐谱。
柯南突然出声：“明白吗，下一个就是你，罪恶的怨恨，在这里消除。”
所有人皆为一愣，看向柯南，柯南解释道：“这时凶手留下的讯息，按照字母和琴键的排列，对应的就是这两句话。”
听到这里，西本先生仿佛魔怔了一般：“是他！麻生圭二他还活着！！”
然而这个想法很快就被当地的警官驳回，当初头骨与齿痕都被对比过，死的确实是麻生圭二无疑，当时的大火将所有的东西都烧毁了，只有保险柜里的乐谱完好无损。
此话一出，毛利小五郎连忙询问那乐谱的下落，乐谱在公民馆的仓库里，警官连忙去拿了仓库的钥匙。
柯南连忙跟了过去，其他人来不及阻止，藤原叶看着手机上发来的消息，案件一出她就让藤原家的管家去查了麻生圭二的信息，包括与麻生圭二有关的人，查了才发现，原来麻生圭二和前任村长的龟山先生，现任村长的黑岩先生，以及西本先生，川岛先生都是从小一起长大的，而且，而且麻生圭二还有个儿子，叫成实......
想到这里藤原叶脑袋有些晕乎，去洗了把脸，谁想到出来只剩下警方的人了，这才一会会，嫌犯就都被放回去了，藤原叶看了眼黑黑的天空，确实很晚了，等等，不对！藤原叶再次拿起手机，月光一共有三乐章，两个死者，放了两乐章，那么还有一乐章！糟糕！
想道这个问题的不光只有藤原叶，柯南同样也想到了，奈何嫌犯都被放回去了。
藤原叶二话不说就叫上目暮警官干紧走，目暮警官也不知道为什么，但是看到藤原叶十分焦急的样子，叫上众人连忙跟上去。
仓库，藤原叶正好碰上了赶来的柯南和当地警官，就在这时琴房突然传来了细微的声音，柯南二话不说就打开了琴房，琴房有两个身影，黑暗中完全看不清，其中一个已经跳窗逃跑，另外一个，正晕倒在地上，凭借着微弱的灯光，柯南认出来这是黑岩小姐的未婚夫。
与此同时，仓库门被打开，藤原叶瞳孔猛缩，西本先生的尸体，被吊在了仓库里！
而西本先生的脚下，正放着一本乐谱，按照之前的方法破解，这是一本遗书......
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