401—600
405-406 星星与香烟的暗号、
419-421 斯托拉蒂巴利欧斯不协调的和音、
428-430 诡异宅院大冒险、
432-433 诡谲家族的委托、
434 满腹疑惑的小兰、
459-463 黑色冲击 组织之手逼近的瞬间、
465-466 超机密的上学路、
467-468 无法回头的两个人、
502-505 黑暗组织之影、
519-522 与服部平次共度的3天、
527-528 黑色相片的下落、
538-551 红与黑的碰撞(红黑篇)、
554-555 卡拉OK包厢的死角、
556 红白黄色和侦探团、
557 柯南VS双重暗号之谜、
558 推理对决!新一vs冲矢昴、
564-566 风林火山、
593-594 鱼儿消失的一角岩
601—800
608 危险的二人组、
609-612 死亡之馆 赤壁、
614-615 侦探团vs抢匪团、
629 引发危机的红色前兆、
630 黑色13的暗示、
631 步步逼近的黑色期限、
632 摇曳的红色目标、
667-672 福尔摩斯默示录、
673-674 紧急事件252、
697-698 幽灵饭店的推理对决、
699-701 侦探事务所挟持事件、
702-703 柯南vs平次 东西侦探推理对决、
708-709 博士的影音网站、
719-720 婚礼前夕、
723-726 侦探们的夜想曲、
733-735 赌上性命的恋爱转播、
736-737 泡沫、热气与烟、
742-743 工藤优作的未解决事件、
751-752 迫近灰原秘密的黑影、
753-756 漆黑的神秘列车(列车篇)、
757 密室中的柯南、
758 解谜的波本、
774-775 又甜又冷的宅急便、
779-780 装满水果的宝箱、
783-784 现场的邻人是前男友、
786-787 朱蒂的回忆与赏花的陷阱、
791-792 小五郎在酒吧里、
793-794 小兰也昏倒的浴室、
797-798 嫌疑犯是京极真
801—1000
804-805 招财三毛猫事件、
807-809 红衣女的惨剧、
812-813 恋爱小说的意外结果、
823-824 气氛僵硬的茶会、
832-836 绯色系列(绯色篇)、
838-839 太阁恋爱的名人战 、
840-841 沉入盛夏游泳池的谜团、
845-846 三个第一发现者、
865-867 县警的黑暗、
869-870 博客女星密室事件、
882-883 好吃得要死的拉面2、
891-892 关系不好的女子乐队、
898-899 不明真相的侦探团、
904-905 结婚申请书的密码、
908-909 樱花班的回忆、
916-917 与17年前同样的现场、
918-919 灵魂侦探杀害事件、
921-922 背叛的舞台、
933-934 试衣间的死角、
936-937 涟漪中的魔法师、
(944-945、949-950、951-952、956-957、964-965、980-981、982-985、)
998-999 寻找玛利亚