宝可梦联盟
距离上次小智离开他们的时间，已经过去了三个月，在这期间，世界的时间被阿尔宙斯调回到了正轨，一切都和原来一样。
小茂成了联盟最年轻的博士，小刚开了一家饲育屋，小霞和艾丽丝也在为她们的水系和龙系宝可梦大师的目标努力着，莎莉娜也从丰缘参赛回来了，小光和小瑶也在卡洛斯的表演赛上取得了不错的成绩，希特隆则成为了联盟的首席机械技师兼顾问，天桐也在联盟附近开了一家咖啡厅，说是为了了解更多人所带来的，那独特的风味，真嗣也呆在联盟做好冠军的工作，艾岚两个月前开始旅行，如今也回来了，也得到了属于自己的超进化石。
一切似乎都在往好的方向发展，但.....
小霞：九十九天了.....
此时，小霞正坐在一颗樱花树下，看着飘零的花瓣，不自觉的伤感了起来。
小刚：是啊.....
小茂：都怪我......
小茂还在为当初自己做的事感到悔恨，自从小智“离开了”，小茂一直把小智的“死”归咎于自己身上，但并没有什么用。
花子（微笑）：好了，别伤心了，这不怪你，而且，我想小智如果看到你们为他伤心，肯定会不开心的。
真嗣：阿姨，对不起.....
花子笑着摇了摇头，表示没关系。
现在，他们正坐在花子家的院子里，此时正直春天，小智当初种的樱花树开花了，他们约定今天到这里聚一聚，也是为了给小智一个“安心”。
当听到小智死的消息时，花子并没有太惊讶，因为在小智死的前一天，花子就已经恢复了（详情见11章），一声妈妈，穿越时空的隔阂，来到了此刻。
当母子还没来得及叙旧的时候，小智就一脸严肃的看着花子。
小智：妈妈，如果我有一天永远离开了你，你会怪我吗？
花子明白了小智什么意思，没有说什么，只是将小智抱得更紧了，眼泪如没拧紧的水龙头一样。
虽然做好了心理准备，只是没想到来到那么突然。小智其实已经知道了自己必须要“付出”一些有分量的“代价”才能让时间回到正轨，现在，世界变回了原来的样子，但并没有完全变回去.....
皮卡丘抱着番茄酱，一脸悲伤的抬头看向围栏边的花，看着看着，皮卡丘突然叫了一声，随即猛地窜了起来，跑向围栏，在靠近的时候，一跃而起。
众人被皮卡丘的举动吓了一跳，急忙起身跑了过去，还没靠近，皮卡丘那带着哭腔但兴奋的叫声就从围栏的另一边传来，随即，一阵熟悉的笑声传入众人的耳膜。
？？：哈哈哈，皮卡丘，我也想你啊.....
在众人的注视下，一顶红白相间的帽子出现在众人眼中，沿着围栏慢慢的移动，当帽子移动到围栏门口的时候。一名头戴帽子，身穿蓝色短袖外套和灰色裤子，配上一双红黑蓝相见的鞋子，肩上趴着一只皮卡丘，一双琥珀色充满活力的瞳孔的少年出现在了众人眼中。
小智：你好！我是来自真新镇的小智，这是我的伙伴皮卡丘，我的目标是神奇宝贝大......哎！等等！我台词还没念完呢！
话还没说完，众人一拥而上。
一旁的花子静静的看着他们，脸上杨洋着幸福的笑容，随即起身走进屋子，被众人压在最下面的小智探出脑袋来，对着准备进屋的花子，用他那“最后”的力气说。
小智：妈妈，我的可乐饼要番茄酱。
花子回头，就看见笑着小智看着自己。
花子也笑着点了点头。
另一边
神之领域
阿尔宙斯：wc！他怎么跑回去的？！不是让你们看好他的吗？！（看着水晶球）
说着，就看着眼前的时空双神，此时的帕鲁奇亚和帝牙卢卡委屈的要死，明明一直都感受到他的气息，为什么人就不见了呢？
阿尔宙斯：真乱来！还没好透就跑出去浪！你们！跟我走！回头再找你们算账！
时空双神（委屈巴巴）：哦.....
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作者晨曦全篇完结撒花啦～
旁白：鼓掌👏....
作者晨曦接下来的剧情你们可能猜的到，谁还记得我写的“神之子初遇篇”？后面的剧情就和前面有关哦～
作者晨曦拜拜～
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