2000年前，人类和神奇宝贝发生了一场大规模的战争，双方伤亡惨重，不少神奇宝贝濒临灭绝。
最后两名人类看不下去了，他们利用自己手中的力量来平息重神的愤怒，并达成了某种协议，战争被迫停止，人类一方伤亡惨重，不少平民百姓家破人亡，妻离子散。而神奇宝贝一方也是惨不忍睹，有的种族惨糟灭绝，有的神奇宝贝一生残疾，还有一些神奇宝贝进化不了，而神兽之中的陆上霸主失去了飞行能力
而停止战争的两名人类分别是波导勇者和超克使者（超克之力的使用者），战争停止后他们但心2000年以后的世界，必境他们的努力只带来了，最多2000年的和平，这时他们只能祈祷出现真正能带来和平的人了………
2000后～～～～～～～～～～～～～
真新镇的医院里，一名男子在手术室门前焦急的等着，傍边的大木博士安慰着他
大木博士放心吧，你老婆和孩子子一定没事的
神秘人我知道了，谢谢你大木博士
大木博士不用谢
手术室里哇的一声传出来，里面的一位医生走出来对神秘人说
医生：恭喜你，是一对龙凤胎，病人与孩子已经没事了，现在己经转到普通病房了
神秘人谢谢你，医生。
医生：哪里，这是我们该做的，现在你可以看你的妻子了
神秘人哦，谢谢你，医生
大木博士好了走吧
神秘人嗯
普通病房～～～～～～～～～～～～～
病床上
花子老公我们的孩呢？
神秘人，和大木博士把们到床前
神秘人你看，这就是我们孩子，男的是哥哥，叫小智，女的是妹妹，叫小星
花子嗯
这时一个电话打来，打断了这美好的时光，神秘人和他说了会话，桂断之后看着花子
花子没关系，你去吧！工作要紧
神秘人嗯，记得不要和他们说有我这样废物的爸爸，到时候该相认时自会相认
花子嗯
花子保重
大木博士保重
神秘人你们也是
说完神秘人就离开了
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