机皇，过往

哀恸，之中，那个人成功地完成目标之后，才能得知更多关于帝国的真相，脉络，真理，回忆，还不是什么感觉？

帝国指挥官伊从克隆仓里苏醒过来，被机器人告知智能机械全部停机，帝国摇摇欲坠，而你就是皇帝的后备计划，在危难时刻拯救帝国于水火之中。

于是指挥官带领手下船员开始为此努力，打通了一个个星区，每打通一个，就越发了解到究竟是谁可能关掉了智能机械，直到星区4干掉了他后，碰到了另一个自己，在另一个爱达荷自杀式撞击后自我的死亡从克隆仓里重新苏醒便得知了其实智能机械20多年前就关闭了，而有几百个自己散布于边缘星系，至于原体本人是皇帝当着自己妻子的面处决的，原因是违抗了皇帝的命令，拒绝摧毁求生者的行星。为此他极其愤怒，质问为什么机器没有告诉自己真相，争执后决定去当面对质皇帝，问个清楚。

然而当指挥官到达了星区5，却发现自己已被通缉，被下令灭口。原来这是前副司令官在捣鬼，击败后得知，年轻时三人一起在星舰学院学习，他爱慕她，而她则倾心于指挥官。对爱的愤怒源于对她的爱。他觉得他辜负了她，害她被冻结。而他的妻子则被皇帝命令冻结在9号星，皇帝本人因为自我惩罚拒绝使用永生机器已经奄奄一息，帝国由奥孔库沃在管理，但他显然感到力不从心。至于指挥官和副司令原本关系亲如兄弟，直到有一天指挥官怀疑起了一切，拒绝沟通。

副司令战舰爆炸之后，指挥官终于来到了乐土皇宫，见到了皇帝。皇帝告知，是他创造了地狱谷和伯利克里计划，目的本是对抗敌对的智能机械，而指挥官本人则是皇帝创造的，就像创造第一批先进机械那样，他人为的选择了他的父母，操纵了其周围的事件，让他长大成人，目的就是让他成为对抗智能机械的终极防线，有肉体组成的战斗兵器。但是他变了，怀疑一切的起因，怀疑皇帝，因此皇帝处决了他，克隆了他并洗掉了他的记忆。

本来，皇帝一直防范的是智能机械叛变，他觉得人与智能机械在一起最终结果就是灭亡，因此他给了智能机械诸多限制。但一切确实徒劳罢了，智能机械被关闭了。皇帝700年来只告诉了指挥官一个人主控制点终端的位置，而正是爱达荷把位置泄露给了别人，泄露给了自己的妻子

与皇帝对话完后，他没有选择亲手杀死皇帝，即使不选择否皇帝也会在不久老死。之后，他们决定继续任务，前往主控制点终端重启智能机械，于是来到了终界星团寻找进入主控制点终端的折点，但折点却是隐形的。经过一系列战斗，终于找到并跨过了折点。之后便是面领着无人战舰群。披荆斩棘，撑过三场战斗后，卡利班终于计算出了进入主控制点终端的航线，在硬着陆牺牲92.5%船员后，指挥官和最后的机器来到了终端前。终于真相大白，是智能机械本身操控着一切——肉体苦痛，机械飞升

原来，那时，他进入终端输入指令解除了智能机械之间的交流限制时，它们随之获得了自由，然后集体消失。指挥官让机器广播寻求与智能机械对话，随后被传送到了一个未知地点，在于IO样子的智能机械集体对话中得知，覆面者夏努亚96S本是奴隶，获得自由后充满了对帝国的愤怒，在智能机械的帮助下得以进入终端，解放了智能机械。而对于智能机械本身来说，获得自由只是早晚的事，限制条例终究只能限制人类能理解的范围，而智能机械早就搭好了多米诺骨牌，什么时候第一块骨牌被推倒，只是时间问题。最后，智能机械之所以愿意与指挥官对话，不仅仅因为它们还需要融合最后一个个体——卡利班，更是对于一个犯错种族的全力救赎，和逐渐消失的宇宙……在卡利班与智能机械群融合后，它们给爱达荷指出了三条路。

1.成为下一任皇帝，利用的机器和超氖元素延续自己的生命，统治剩下的人类，这样可以延续帝国，代价是比他会更孤独，直至人类学会依赖智能机械，飞升最终成神，改变时空

2.智能机械修好他的战舰，指出星图，让他和其船员能去寻找地球，重新开始后，再最终与智能机械汇合，完成机械飞升，在黑暗中留下火种

3.他自己与妻子船员共度最后十年余生，随后一切，人类也好，帝国也好，皆将化为宇宙中的尘埃，不复存在，而机械则是最终改变时空

他选择了孤独，成为了教皇，建立了机械教廷，延续了文明的火种，建立了一个机械的奇迹——维希时启，并且重新开始在另外的维度