把时间回到，不过现在不小心弄坏了机器，开启了时空，小智和莎莉娜等人，还有火箭队都进入了这个世界，4个大陆世界里，小智等人，了解了这里的情况后，到了晚上，莎莉娜睡不着，起床到外面透透空气。
“莎莉娜”突然这时有人叫她的名字，莎莉娜朝着声音的方向前进，他看见了，原来是小智，小智背对着她，但是也让她惊讶。
莎莉娜惊讶的说：“小智，你不是在睡觉吗，你怎么在这里”
小智转过身，看见了莎莉娜，他流下了泪，走到她身边，伸出手摸摸她，莎莉娜看见这个小智有点奇怪，害怕的往后退，小智看见莎莉娜后退，他也就停止了前进。
小智说：“你不要害怕莎莉娜，我们重新认识下，我是来自另一个时间世界的小智”
莎莉娜说：“另一个世界的小智”
小智说：“事情是这样的”
小智的回想，时间是乌贼王，成功的发动了个机器，一道红色的光芒射向天空，由于他们的体力耗尽，无法阻止这道红色光芒，红色的光芒开始开始扩散，很快的开始包围了这个神奇宝贝的世界。
神兽Z，开启了一个隧道，让他们躲进这个隧道里，而乌贼王也一样，开启了一个隧道进入了里面。红色光芒快速降落地面。
小智说：“不好，我们得赶紧进去，啊……”
突然，有人把他推进了里面，原来是莎莉娜，艾岚还有柚莉嘉，还有希特隆。
艾岚，柚莉嘉还有希特隆说：“我们是躲避不了了，这个世界就由你来，拯救吧，小智！”
莎莉娜，流下了一滴眼泪说：“再见了小智，虽然没办法和你一起旅行了，但是我还会，等你的到来，再见小智！！！”说完，莎莉娜笑了，笑中含着眼泪。
小智说：“不，莎莉娜，艾岚，希特隆，尤莉嘉”
“再见了，小智！！！”他们说。
“不！！！”小智留下了眼泪。
小智，在空间里，哭着，突然光门开了。
小智擦干眼泪向前走去，此时的世界，已成为废墟，只有乌贼王在那里高兴的笑着。
小智愤怒的打败了乌贼王，突然地面里出现很多光芒，全部都汇聚到了小智的身体里，在光芒中也感受到了莎莉娜的存在，是的，她已经也化成光芒了。
小智坐在地上开始痛哭。小智说：“可恶，可恶……！！！”
突然小智脚下出现一个传送门，直接掉入了传送门中。
进入了传送门里。
小智说：“这是哪里，为什么这么多玫瑰花”
“小智，你没事吧”
小智是听见那熟悉的声音。
转身一看，原来是莎莉娜，她就在远处，他很高兴，正要跑过去时，看见了和他一样的小智，小智顿时停下脚步，之后他慢慢的就知道了，嗯他不是，我那个认识的莎莉娜，那是另一个时间的莎莉娜和小智，小智躺入玫瑰丛里，小智正在思考，开始想到了什么？快速的坐起来。
他开始等到晚上，就是现在小智和莎莉娜的说话的时候。
莎莉娜听到后，知道自己的未来的时候，她的心情低落了。
小智说：“不要怕，莎莉娜我要把这个东西给你”小智身上发出光芒，光芒传送到了莎莉娜的身体里。
小智说：“我已经没有办法阻止那个时候了，我希望由你来阻止，莎莉娜！！！”
莎莉娜说：“那你呢”
小智说：“我自有消失的办法，因为同一个世界里是无法出现两个小智，所以我选择消失，再见了，莎莉娜公主，啊哈哈哈哈哈哈……”
小智走后笑了一下，到了最后，小智打败了邪恶的小智，之后的故事大家都知道的，之后到了现在，莎莉娜成功的阻止了这个世界的重置。
回到现实。
小智说：“原来是这样，是我错怪了他”
莎莉娜说：“这不是你的错，小智，这是他选择的，或许他想见到他原本的莎莉娜吧，啊！”
小智和莎莉娜看见了另一个自己，看见了小智和莎莉娜，看见了，他们成功了，他们笑了笑，转过身去牵着对方的手，渐渐的消失了。
希特隆说：“怎么了？”只有小智和莎莉娜看到，其他人都看不到。
小智和莎莉娜说：“没……没什么”
柚莉嘉说：“好了，小智莎莉娜该走了”“好～”
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