在休闲都市的兰普尔其市的沙滩上，明媚的骄阳、清澈适宜的海水，最最最重要的当然是那些身穿比基尼、展示着傲人身姿的小姐姐们
小码头是进去大陆往来的码头港口，承担着这座城市的经济，所有的经济来源都靠着海运进出口货物。
两人赶到码头附近的通信船都已经出发了，下一班时间发船要在三个小时候出发，小智在等待着下一艘船的到来。
在当他们百无聊赖坐在岸边等待着，水里一只墨海马冒出水面，小智等人看到墨海马受伤，而小墨海马在水面吐出墨汁画出水母的图案，想要告诉小智等人讯息。
但可惜小智等人并没有明白它想表达的意思，墨海马只能在海里干着急，突然远方发生大爆炸，那是上一艘出发的轮船。
只见轮船发生大爆炸，发出震天动地的声响。引起了小智等人的注意，小智两人看到船上还有很多旅客担心起来
另一边船上的旅客们第一时间纷纷从船上跳到水中，小智两人看到落水的旅客。赶紧将自己的水系宝可梦召唤出来去解救游客。
小智杰尼龟，暴鲤龙快救人
小智两人在附近找了小艇，将落水的行人都救上来。救上来的人告知三人去找这海上的艇长
小智两人便去找艇长，艇长是一位年老古稀、性情古怪的老婆婆。她是这附近最有钱的房产商人，海上那超级豪华的旅馆和饭店都是她的产业。
她的产业侵占了玛瑙水母们生存的领地，所以这些引起了玛瑙水母们的反击。她将责任全部推给了玛瑙水母的责任，她拜托小智两人赶出这些令人讨厌的生物，给与他们财富、食物
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