内容均由百度提供。一、 赤井秀一（Rye）
说到黑衣组织中的卧底，最成功的大概就是FBI的搜查官赤井秀一了吧，他曾经成功打入黑衣组织内部，获得很高的地位，并且获得“黑麦威士忌”（Rye）的代号。从后来组织对他的忌惮（首领乌丸莲耶认可的“银色子弹”），以及琴酒对杀死他志在必得的情况来看（琴酒始终在针对他，甚至对他的诈死也抱有怀疑），赤井秀一极有可能曾经接触到一部分黑衣组织的核心秘密，而这是其他卧底至今未曾做到的事情（不是琴酒太弱，只是卧底太强）。
可惜赤井秀一一直以来都太过冷峻，我们至今不知道当初他在组织里做了什么，又知道些什么。在以诈死帮助水无怜奈卧底黑衣组织之后就化名冲矢昴寄住在工藤新一的家里，暗中保护灰原哀，为柯南等人提供了不少帮助。
二、 水无怜奈（基尔）
水无怜奈的真名叫做本堂瑛海，是本堂瑛佑（就是小兰那个呆呆傻傻，但是好像隐藏的很深的倒霉同学）的姐姐，表面上是日卖电视台的女主播，其实是黑衣组织的一员，代号基尔（Kir）。不过她的真实身份是原CIA谍报员伊森·本堂的女儿，四年前和父亲一起进入黑衣组织卧底，后来其父为了掩护她的身份自杀身亡了。
在某次暗杀行动中发生车祸，受到FBI的保护，并且在赤井秀一的帮助下获得琴酒的信任，再次进入黑衣组织，同时答应向FBI提供组织的情报，条件是FBI要保护她的弟弟本堂瑛佑。
三、 安室透（波本）
安室透本名降谷零（说实话估计都没人记得这个名字，习惯了叫他安室透），组织代号“波本”，刚开始出现时一度让柯南等人十分紧张，后来才发现原来他是日本公安警察派入黑衣组织的卧底，之后经常与柯南探讨相关的问题（虽然更多时候是探讨一些例如怎么做三明治比较好吃之类的问题…）。
四年前曾经和赤井秀一以及同为卧底的好友诸伏景光一起参加某次行动，后来诸伏景光的卧底身份暴露，而在他身旁的赤井秀一却没能阻止他自杀，所以痛恨赤井秀一（其实只是找个借口掩饰自己心中的悔恨吧）。虽然得到赤井秀一死亡的消息，但始终保持怀疑，曾经装扮成“伤疤赤井”的样子试探赤井身边人的反应，并且调查过冲失昂，结果反而被冲失昂弄清楚他公安卧底的身份（部长没看最新的剧场版，所以目前只知道这些情报）。
四、 伊森·本堂
代号不详，本堂瑛海（水无怜奈）和本堂瑛佑的生父，和女儿一样是CIA的谍报员，后来潜入黑衣组织卧底。在某次交流情报的时候发现了女儿瑛海的失误，所以为了保住瑛海的性命，消除她的嫌疑，在经过一番布置之后选择了自杀，以此掩护女儿的身份。
五、 诸伏景光（苏格兰威士忌）
诸伏景光是长野县警诸伏高明的弟弟，也是安室透在警校的同学兼好友，后来和安室透一起进入黑衣组织卧底，代号为“苏格兰威士忌”。在某次行动中身份暴露，所以自杀殉职，正是因为和他一起行动的赤井秀一没能阻止他的自杀，安室透才会这么痛恨赤井秀一。
仔细算算，黑衣组织中的卧底只有五个，而且两个已经死亡，一个脱离组织之后诈死，现在真正还留在组织里的只有两个人，也就是波本和基尔，大家可以不用再为琴酒担心了（如果后面不会又跳出来其他卧底的话）。
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他们是在警校招的人吧
琴酒：一群猪队友，带不动
动漫震惊部[作者]：琴酒：青山老贼，我要辞职！
琴酒是这部动漫中最惨的一个除了基友伏特加其余的几乎全是卧底（估计是招人的时候走错地方了）
胡胡胡咿呀嘛2L回复学霸No1：rum了解下
犹格萨隆本体：那辆保时捷也开了900多集了
诺糖星星回复百梦九十九个你：爱尔兰可能也是在《漆黑的追踪者》中，爱尔兰为柯南挡枪而死
安室透说，我明明是最帅的反派，尽然因为帅变成了正派，琴酒兄弟，抱歉了啊，帅也是罪唉😔
真相永远只有一个！！ 卧底永远不止一个！！
琴酒:“我是名杀手琴酒，我的名言是卧底永远不止一个”
还有英国军情六部的司陶特，加拿大CSIS的阿夸威特，德国那什么部门的威士莲，以上三人已分别被科恩，基安蒂，Gin（琴酒）给做掉了
琴酒太不容易了，万一以后伏特加也是卧底的话，，，，，别忘了，琴酒已经杀了德国卧底，英国卧底，中国卧底，意大利卧底了
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