周末一年一度的读书日在米花图书馆举行活动。毛利小五郎带着柯南、小兰还有布丁来参加活动。今天米花图书馆人非常多，气氛很好。
柯南找到侦探类的书籍开始津津有味的看，小兰也找到喜欢的书籍带着布丁开始安静的看起来。毛利小五郎却和旁边的女大学生聊的很开心。
在图书馆的角落，一个老人和一个女孩在聊天。女孩一脸的冷漠，老人劝说着什么，最终两人不欢而散。老人不知道在人群中寻谁，一直在四处张望，最终停留在一个人身上。走了过去，轻声说。
万能角色(老人)毛利小五郎先生，快救救图书馆里的人吧。那女孩在这里安装了炸弹，她要和这里一起消失，去见我那可怜的儿子。
毛利小五郎你说什么？有人在图书馆里安装了炸弹！！！你有什么线索吗？
万能角色(老人)是的，请你要快点找到炸弹，让这里的人们活下来！这是那女孩早就写好的遗书，还有我儿子送她的手表。
毛利小五郎好的，就交给我名侦探沉睡的小五郎吧！
老人说要去找东西来挽救那个女孩，就匆匆的离开了。那封遗书的内容是：女孩的未婚夫以前是米花图书馆的馆长，后来被大家冤枉他私自购入盗版书，再借用米花图书馆出售盗版书。被逮捕后在监狱中自杀了！所以女孩要为他报仇，今天在这里安装炸弹，她还要和这座米花图书馆里的所有人一起消失。
柯南和小兰了解整件事情后都在思考要怎么办，这里那么多人。要在不被大家发现的基础上找到炸弹。柯南先让小兰去隐蔽的地方报警，自己去找馆长。
柯南馆长叔叔，毛利叔叔查到图书馆里有炸弹，他要你找个借口把大家带出这里。
万能角色(馆长)好的，我就提前带大家去前面的广场举行读者签名合影活动吧，这里就交给名侦探了。
毛利小五郎和柯南开始寻找炸弹，小兰拿了那只手表让布丁根据气味悄悄的寻找炸弹。经过一番寻找，小兰在馆长室的椅子下找到炸弹。她装作很惊讶的样子呼叫毛利小五郎。
小兰爸爸，我……我发现炸弹了！！！
毛利小五郎小兰，不要乱动，我们来了！
毛利小五郎和柯南一起冲过来，柯南把抱着布丁的小兰拉到身后。目暮警官带着队员赶到，拆弹组的成员开始行动，经过检查这只是一个普通的炸弹装置，很快被拆除了。
大家也在楼顶找到了那个女孩，她知道炸弹已经被拆了，感觉非常绝望。
万能角色(女孩)既然炸弹已经被你们拆了，看来连老天也不帮我，我只好从这里跳下去，到另一个世界去和他团聚。
小兰你不要做傻事，你真的死了，谁来帮你未婚夫找到证据，证明他的清白呢？
万能角色(女孩)你说的对，我不能这样死掉，我要找到证据，让大家知道他是清白的。
那位老人也重新回到米花图书馆，他是那个男孩的父亲，他找到了儿子的日记。内容提到他儿子知道有同事在私下大量购入和转售盗版书，他劝同事去自首。但同事并没有去，后来被发现了就栽赃给他。
通过柯南的调查，知道日记里的那位同事就是现任的馆长。最终他也全部承认了自己的罪行，被警方逮捕了！
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