路西法基多拉走后的一个月，人类已经数不清，短短不到半年里，东京都遭受到了怎样的打击，但也不得不接受一个现实，这都是人类自食恶果，地球上的怪兽反而间接性的拯救了它们。
在这期间，新闻上报道，最近夜里频繁出现谋杀案，且受害者的伤势不像是人为，这让人们不得不想起在三年前那只令哥斯拉陷入苦战的怪兽，美加基拉斯。
哥斯拉与魔斯拉所在的岛上，机械哥斯拉降落下来，哥斯拉表示惊讶的问候机械哥斯拉这几个月都去哪了？而且这伤又是怎么复原的。
机械哥斯拉只是站在原地，魔斯拉察觉到了不对劲，机械哥斯拉动了起来。
机械哥斯拉：你们，都会死。
机械哥斯拉身体发射无数导弹，这密密麻麻的程度，机械哥斯拉无论打谁都不可能用这么无脑的战斗方式。
哥斯拉连忙将魔斯拉护在身下，机械哥斯拉又发射出等离子射线攻击着哥斯拉，哥斯拉不解的大吼机械哥斯拉为何又要攻击它们，机械哥斯拉依旧没有回应。
随着机械哥斯拉的胸口展开，里面冒出了无数的美加纽拉，哥斯拉表示极度的震惊，机械哥斯拉什么时候和这些玩意凑合到一起了？而且这翔龙怎么还有活着的？
机械哥斯拉开始大肆破坏整座岛，安基拉斯前来与他对峙，但机械哥斯拉被控制以后完全的适应了这副身体。
安基拉斯将自己变成一个球滚了过来，机械哥斯拉一刀将其挑飞，又是断断续续的几发等离子射线打落了安基拉斯，哥斯拉冲上来一尾巴甩倒了机械哥斯拉，又扑倒他身上一爪子挠碎了机械哥斯拉半边脸，但机械的外壳下，还有着无数的美加纽拉，美加纽拉全部扑倒了哥斯拉的身上，哥斯拉奋力挣脱，机械哥斯拉起身一脚踹翻了他，等离子热光刃抽出，一刀刺进哥斯拉的第二脑，开始吸收体内的放射性能量和生命能量。
哥斯拉的第二脑受损，身体极度虚弱，已经无力挣扎，任由身上的美加纽拉吸收自己的能量，这是哥斯拉离死亡第二进的一次了，但还好，魔斯拉一个冲撞撞倒了机械哥斯拉，但同时吸引到了其他美加纽拉的注意，美加纽拉全部扑到了魔斯拉的身上，魔斯拉完全抵抗不住，摔在地上。
机械哥斯拉用推进器一个助推起身，抬起手，将胳膊上的导弹发射器对准哥斯拉，下一秒，导弹发射，拐了个弯打倒了想偷袭的安基拉斯，这波操作机械哥斯拉本人绝对做不出来。
两只怪兽的生命能量在被慢慢吸走，生命危在旦夕，安基拉斯再次冲了过来，不顾机械哥斯拉的轰炸，撞倒了他，又开始驱赶哥魔身上的美加纽拉，机械哥斯拉起身，抽剑对准了他，但没有下手，体内本人的意识还在努力抵抗，最后一刀刺进了自己的核心，在原地站着，身体停止了运作。
但脑海中那卵的声音再次响起。
翔龙卵：算了，你可以退下了，对你来说，还有更重要的事。
机械哥斯拉被美加纽拉抬走，哥魔保住一条小命，但美加纽拉收集的能量对卵来说，已经足够了。
一个有史以来最大的威胁，将要诞生。
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