反派人物
在这一部里东方末和蓝天画在龙源纪的龙号角岛被凶兽龙中原暗龙黑化，与洛小熠决裂成为了敌人。后被中原暗龙逼服下毒龙芯让其在14天内找到龙的密令，并且交给东方末恐龙令使用。回到人类世界后复活了原始恐龙博物馆的六个恐龙蛋，复活的小恐龙分别是:披风神翼龙、闪亮三角龙、火焰伶盗龙、土剑龙、千棘龙、重甲龙，但东方末仅仅只是把它们当作能战胜洛小熠的工具而已。在被雷古曼打败后东方末用恐龙令将六只原始小恐龙长大变得强大了。这六只小恐龙都是传奇龙六大恐龙的孩子，在还是恐龙蛋时就被传奇龙送离了龙源纪。
第14集东方末得到重甲龙的能量卡和披风神翼龙的能量卡后使卡维力和森美拉合体融合进化为黑暗重甲兽龙，第20集因为雷吉有了双龙核卡森被打败，同时除了重甲龙其他的小恐龙已逃离恐龙工厂，第22集和蓝天画离开了恐龙工厂回到了垃圾场，小恐龙们也被卡维力和森美拉又抓了回来。第25集吸入双龙核黑洞的卡森和小恐龙们融合成为了撒旦魔龙。第28集在撒旦魔龙抓了索里和加比纳后一再逼迫洛小熠而成功当上了斗龙战士的队长，并且得到了太古教授交给洛小熠的斗龙卡册。第29集狄古用计将太古教授的金象和木象属性斗龙卡给东方末和蓝天画，洛小熠等人进入了东方末和蓝天画被黑化前的记忆里。第30集洛小熠等人在东方末和蓝天画被黑化前的记忆里见证了东方末和蓝天画被中原暗龙黑化的一幕，但遇到了黑亡龙的阻碍，斗龙手环都被破坏。最后东方末与蓝天画被带回阿莱达净化。
东方末
性别:男
年龄:10岁
年级:小学四年级
属性:暗象力量
战斗武器:斗龙手环\\暗象斗龙号角\\恐龙令
斗龙拍档:卡维力
介绍:与以前的性格相比发生了巨大转变，受黑暗力量影响开始变得奸诈狡猾，不信守约定，为了变强对付斗龙战士不择手段，完全被黑暗力量控制，意念与恐龙令融为一体，伤害斗龙战士之间的友谊;被力量蒙蔽了理智，最后彻底迷失本性，做出非常可怕又伤天害理的事。
蓝天画
性别:女
年龄:10岁
年级:小学四年级
属性:暗象力量
战斗武器:斗龙手环\\风象斗龙号角
斗龙拍档:森美拉
介绍:心直口快，有点早熟，个性有些小迷糊，却喜欢装得像大人一样。爱贪点小便宜，爱玩爱吃爱幻想，经常闯祸，跑步飞快，绰号:风一样的女子。
反派宝贝龙
卡维力
属性:暗
其他称呼:黄小子(雷古曼称呼)、卡大大
拍档:东方末
爱好:战斗
介绍:混合了人类中代表"欲望"的暗象DNA，因此力量强大，战斗欲望非常强烈。喜欢吸收暗能量，充满强大的力量，表现欲十足。获得暗属性力量后变得非常强大，一个人就可以打雷古曼和加比纳两个，甚至直接单挑两只凶兽龙，通过吸收黑暗能量，保持自身的力量。具有分身及复制对手战斗力的能力。
武器:绝望骑士枪
武器招式:绝望骑士枪，逆鳞回旋击，秘传黑旋风，二神枪击，电光雷火击，急转叶落返，八手舞拿，真枪三禁突
逆鳞回旋击:用绝望骑士枪发出强大的力量攻击对手，使对手无法反击。
口头禅:咔嚓!/让战斗来得更猛烈些吧!
进化形态:宝贝龙-铠甲战龙-重甲兽龙-究极兽龙
必杀技:炫光爆裂(宝贝龙形态)，暴力黑雨(铠甲战龙形态)
暴力黑雨:降下含有黑暗力量的暴雨荼毒对手，使对手短时间无法反击。
战斗类型:破坏
相关合体兽龙:卡森兽龙，撒旦魔龙
森美拉
属性:风
其它称呼:美拉公主
拍档:蓝天画
爱好:吃棒棒糖
介绍:混合了人类中代表"仁爱"的木象DNA。因此个性十分的活跃且百变。最大特点是一双彩虹般的七彩翅膀。十分爱美，精力充沛，好表现自己，很爱玩，无忧无虑。
口头禅:亲!
进化形态:宝贝龙-铠甲战龙-究极兽龙
必杀技:奇异光线(宝贝龙形态)，迷风术(宝贝龙形态)，自由之翼
自由之翼:汇聚风力，形成环形风球发起攻击，使对手陷入迷茫状态。
武器:风之回旋刃
相关合体兽龙:卡森兽龙，撒旦魔龙
黑暗重甲兽龙
卡森兽龙
组成:卡维力、森美拉
拍档:东方末、蓝天画
武器:炼狱三叉戟(由风之回旋刀、绝望骑士枪组合而成)
形态:重甲兽龙
属性:螺旋，拥有高速旋转攻击和吸收能力
必杀技:暗风回旋
介绍:第四部第14集东方末得到重甲龙的能量卡和披风神翼龙的能量卡后使卡维力和森美拉合体融合进化为黑暗重甲兽龙，力量强大，后与六只原始恐龙吸入黑洞中，合体成撒旦魔龙。
龙源纪的六大凶兽龙始祖
南狱土龙
属性:土
特征:体型庞大，双拳使出的力量能破坏任何防御
技能:绝望之锤
介绍:南狱土龙因见到森美拉产生好感，十分憨厚愚笨、头脑简单。
中原暗龙
属性:暗
特征:无脚像幽灵一般，狡猾阴险，为了目的不择手段
技能:暗龙变幻、暗原禁锢、终级暗龙变幻
介绍:中原暗龙使用诡计企图再引诱东方末与斗龙战士为敌，却被斗龙战士识破，被恢复记忆的东方末算计而逃，所以不得不将斗龙战士们分散。
东炬火龙
属性:火
特征:头上的尖角能发出炙热火焰
技能:东山火炮、炽热光线、烈焰冲击
介绍:东炬火龙是第一个斗龙战士们在龙脉神峰遇到凶兽龙，曾被洛小熠和雷古曼制服，但没有把它消灭，于是设计逃跑，引诱斗龙战士到冰地。后来一系列的战争中，可以看出东炬火龙做事情不沉稳，总是蹩手蹩脚，轻敌心理很严重。
北冥光龙
属性:光
特征:拥有强大的光象能量，战斗力极强
技能:闪电切割、冥王绝杀、北冥光罩、圣光堡垒
介绍:是斗龙战士遇到最强大、最厉害的凶兽龙，能承受强大攻击。北冥光龙原本是星龙塔的守护星龙，可却早已厌烦自己的工作，一次偶然机会遇到黑亡龙，在黑亡龙诱导下，北冥光龙为了获得更大的力量与自由，跟随黑亡龙做它的手下。后来，北冥光龙渐渐意识到正义真正含义，开始悔悟。
蚀海冰龙
属性:水
特征:身上拥有凶猛的海洋力量
技能:暴雪袭击、完美冰封
介绍:蚀海冰龙擅长吼叫。喜欢口出狂言，轻敌，导致经常被斗龙战士所击败，在54集中，力量被中原暗龙所抽取，不复存在。
西凛风龙
属性:风
特征:双手能化作手刃，斩杀一切
技能:西凛绝杀
介绍:西凛风龙是凶兽龙的老二，被力量提升的森美拉击伤。最终由卡森兽龙合力击杀于绝望深渊内。
六头怪龙
介绍:六头怪龙，龙号角岛镇守之龙，因为光、土、火、水、风、暗六个脑袋而得名，攻击力全面且强大。六头怪龙每一个龙头都有一个对应相应属性的斗龙号角，只要吹响号角就能将斗龙宝贝进化为铠甲战龙形态。若要击败六头怪龙，就必须将六头怪龙的六个龙头一同击杀，第5集里六头怪龙被加比纳用加勒比海神之弓发出的海神箭消灭。
必杀技:怪龙呼啸
反派BOSS
撒旦魔龙
属性:暗
组成:卡森兽龙(卡维力，森美拉)，六只原始恐龙，黑暗法力(恐龙令)
拍档:东方末、蓝天画
形态:究极兽龙
技能:魔鬼冲击焰炮，暗黑无形斩，撒旦之风
介绍:东方末为救回卡维力，通过卡森产生的黑洞逆螺旋力量加以黑暗法力(恐龙令)以及六只原始恐龙力量，弄巧成拙而诞生的邪恶恐龙，具有强大的黑暗力量，所到之处能产生世界末日的幻觉，因此东方末彻底黑化，并与恐龙令的力量融为一体，与撒旦魔龙成为黑暗邪恶的代表。撒旦魔龙自称为"本大帅"，撒旦魔龙是因为双龙核黑洞力量形成的混合巨龙，而黑洞就是撒旦魔龙的死穴，黑洞就在撒旦魔龙的嘴巴里，所以撒旦魔龙一张口说话就有黑雾喷出。雷吉和加索虽然知道了撒旦魔龙的弱点，但还是靠近不了撒旦魔龙，双龙核为了保护雷吉自行将雷吉弹了出去。雷吉在攻击撒旦魔龙同时自己的武器雷神大剑也碎了，就在此时撒旦魔龙被传奇龙的招式圣降击中而被打败。六只小恐龙、卡维力、森美拉也变了回来，六只小恐龙看到龙的密令在乌鸦龙手里把乌鸦龙给带去了龙源纪。但是卡维力、森美拉、东方末、蓝天画都陷入了昏迷，太古教授为他们注入了新的能量，不久就会醒来。
黑亡龙
属性：暗
必杀技：恶魔阵、黑电、黑色咆哮
介绍：本部一切黑暗力量的始作俑者，黑暗恐龙之王。第四季中的黑亡龙处于封印状态。为了复活，他们抓走阿迪，并且灵魂附在阿迪身上！
复活魂器：龙的密令
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