引子

由于一颗神奇的黑磁石降落夸克星球，使得爱好和平的夸克族分裂为夸克、暗黑两族，奈亚公主也因暗黑族的出现而诞生，信念不同的两族为了争夺这颗黑磁石陷入了长久的战争，最终暗黑族获胜，夸克星球陷入了长久的黑暗。夸克族带着黑磁石来到地球，并驻扎在祖先希丝娜女神留下的位于地球附近平行空间的萌学园，守护着这颗星球

一百多年后，夸克族与暗黑族展开了浩大的黑夸大战，这场战役中，暗黑族的多数分支被封印，暗黑大帝及其残余势力被逼至地下水道。暗黑大帝的几颗灵石海地司、轮回血石、冥月顽石在战役中散落各地，黑磁石重回萌学园手中，仅有塔塔鲁石留在暗黑大帝体内维持其能量不灭。

而在此之后，萌学园又诞生新一代的的萌骑士和奈亚公主，他们携手共进对抗暗黑大帝，在这期间，他们失去了亲人、爱人和朋友，但他们一直坚定信念，一直维护萌学园的和平。

可是暗黑大帝并没有完全被消灭，他一直在宇宙某个地方恢复能量，而萌学园的故事又再次要开启新篇章……